松園別館約建於民國三十二年，早期曾是花蓮港「兵事部」辦公室，與附近的「放送局」（現中廣花蓮台）、「海岸電台」（現中華電信）相連為日軍在花蓮重要軍事指揮中心。又傳言神風特攻隊出征前也會在此接受天皇賞賜「御前酒」，可知此園於日治時期亦是高級軍官之休憩所。終戰後，此地由國民政府軍隊接管，民國三十六年管理單位為陸軍總部，曾作為美軍顧問團軍官休閒渡假中心。民國六十六年改為國有財產局所有，六十七年再交由行政院退輔會管理迄今。民國八十九年由花蓮縣政府將本園編訂為「歷史風貌專區」，九十年獲選為文建會「閒置空間再利用」試辦點之一，並入選「台灣歷史百景」。