二次世界大戰末期，台灣仍是日本的殖民國，日軍與美軍戰況陷入膠著，日方決定在花蓮成立軍事指揮中心，於西元1942年(民國31年)年興建完成，當時稱為「兵事部」，也就是如今的松園別館。

為什麼日本人會選擇這個地方呢？主要是因為位在這樣邊坡上的建築，擁有制高點的地理優勢，視野良好，不但可以監控眼前太平洋海面上的軍艦船隻，也能掌握從前附近南機場飛機的起降，加上滿天茂密的松樹枝葉，讓這棟灰色建築更是顯得隱密，作為一個軍事基地，自然是最適合不過的了。